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家系连锁分析

家系连锁分析

适用于单基因病研究,连锁分析通过分析减数分裂过程中染色体重组的情况,判断snp位点与疾病位点之间是否连锁,以及连锁的紧密程度(lod score)。然后利用阳性区域推断单倍型来明确家系中DNA的传递关系,找到交换发生的位置进一步缩小候选基因的范围。

  

基本分析流程

 

家系连锁分析

 

家系连锁分析

适用于单基因病研究,连锁分析通过分析减数分裂过程中染色体重组的情况,判断snp位点与疾病位点之间是否连锁,以及连锁的紧密程度(lod score)。然后利用阳性区域推断单倍型来明确家系中DNA的传递关系,找到交换发生的位置进一步缩小候选基因的范围。

  

基本分析流程

 

 

部分结果展示

 

Lod plot图: 横坐标是染色体位置纵坐标是lod score值

 

单倍型图:可以从图中看到病人共享相同的单倍型

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